MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 43805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	AC	3	6	53	58	50 %	0 %	0 %	50 %	476417162
2	NC_020517	CTT	2	6	64	69	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
3	NC_020517	GA	3	6	95	100	50 %	0 %	50 %	0 %	476417162
4	NC_020517	GT	3	6	131	136	0 %	50 %	50 %	0 %	476417162
5	NC_020517	TG	4	8	155	162	0 %	50 %	50 %	0 %	476417162
6	NC_020517	AC	3	6	173	178	50 %	0 %	0 %	50 %	476417162
7	NC_020517	TTG	2	6	211	216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	476417162
8	NC_020517	AGT	2	6	264	269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417162
9	NC_020517	GC	3	6	353	358	0 %	0 %	50 %	50 %	476417162
10	NC_020517	CTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
11	NC_020517	CAG	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
12	NC_020517	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
13	NC_020517	A	6	6	407	412	100 %	0 %	0 %	0 %	476417162
14	NC_020517	CG	3	6	489	494	0 %	0 %	50 %	50 %	476417162
15	NC_020517	CCG	2	6	726	731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
16	NC_020517	TGC	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
17	NC_020517	TGA	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417162
18	NC_020517	GGC	2	6	778	783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417162
19	NC_020517	TTC	2	6	805	810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
20	NC_020517	A	6	6	873	878	100 %	0 %	0 %	0 %	476417162
21	NC_020517	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
22	NC_020517	GC	3	6	1070	1075	0 %	0 %	50 %	50 %	476417162
23	NC_020517	CCG	2	6	1088	1093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417162
24	NC_020517	CTT	2	6	1152	1157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417162
25	NC_020517	ACC	2	6	1159	1164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417162
26	NC_020517	CAT	2	6	1188	1193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417162
27	NC_020517	TCG	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417162
28	NC_020517	TCA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417162
29	NC_020517	GTG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417162
30	NC_020517	TCGC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	25 %	50 %	476417162
31	NC_020517	ATGC	2	8	1366	1373	25 %	25 %	25 %	25 %	476417162
32	NC_020517	GCA	2	6	1398	1403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417162
33	NC_020517	ACTG	2	8	1434	1441	25 %	25 %	25 %	25 %	476417162
34	NC_020517	CCG	2	6	2062	2067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
35	NC_020517	CAC	2	6	2205	2210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417163
36	NC_020517	TGA	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417163
37	NC_020517	A	6	6	2293	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	476417163
38	NC_020517	ACC	2	6	2307	2312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417163
39	NC_020517	GCC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
40	NC_020517	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417163
41	NC_020517	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
42	NC_020517	TCA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417163
43	NC_020517	ACCG	2	8	2547	2554	25 %	0 %	25 %	50 %	476417163
44	NC_020517	CAAG	2	8	2822	2829	50 %	0 %	25 %	25 %	476417163
45	NC_020517	ATG	2	6	2889	2894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417163
46	NC_020517	CCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
47	NC_020517	CCG	2	6	2929	2934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417163
48	NC_020517	TCGATA	2	12	2959	2970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	476417163
49	NC_020517	CGA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
50	NC_020517	AAGG	2	8	3015	3022	50 %	0 %	50 %	0 %	476417163
51	NC_020517	GCA	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417163
52	NC_020517	CTG	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417163
53	NC_020517	TGG	2	6	3307	3312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417164
54	NC_020517	TGC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
55	NC_020517	GTA	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417164
56	NC_020517	GAC	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
57	NC_020517	CAC	2	6	3434	3439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417164
58	NC_020517	ATC	2	6	3516	3521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417164
59	NC_020517	CGTTT	2	10	3536	3545	0 %	60 %	20 %	20 %	476417164
60	NC_020517	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
61	NC_020517	AGC	2	6	3670	3675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
62	NC_020517	GC	3	6	3674	3679	0 %	0 %	50 %	50 %	476417164
63	NC_020517	AGC	2	6	3691	3696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
64	NC_020517	TGCG	2	8	3799	3806	0 %	25 %	50 %	25 %	476417164
65	NC_020517	GCTG	2	8	3821	3828	0 %	25 %	50 %	25 %	476417164
66	NC_020517	TGA	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417164
67	NC_020517	GAC	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417164
68	NC_020517	CGT	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417164
69	NC_020517	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	476417164
70	NC_020517	CCG	2	6	4309	4314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417164
71	NC_020517	TC	4	8	4414	4421	0 %	50 %	0 %	50 %	476417165
72	NC_020517	CGC	2	6	4448	4453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417165
73	NC_020517	TGA	2	6	4518	4523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417165
74	NC_020517	GGT	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417165
75	NC_020517	CGG	2	6	4776	4781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417165
76	NC_020517	AGA	2	6	5004	5009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417166
77	NC_020517	AGC	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
78	NC_020517	GGC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
79	NC_020517	CAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417166
80	NC_020517	CAC	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
81	NC_020517	TCG	2	6	5219	5224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417166
82	NC_020517	GCTG	2	8	5244	5251	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
83	NC_020517	GCCA	2	8	5257	5264	25 %	0 %	25 %	50 %	476417166
84	NC_020517	GTG	2	6	5302	5307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
85	NC_020517	TGA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
86	NC_020517	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
87	NC_020517	CGG	2	6	5391	5396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
88	NC_020517	TGG	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
89	NC_020517	CGG	2	6	5409	5414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
90	NC_020517	CGG	2	6	5427	5432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
91	NC_020517	GTG	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417166
92	NC_020517	ACC	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
93	NC_020517	CGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
94	NC_020517	CGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
95	NC_020517	TCA	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
96	NC_020517	CCA	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
97	NC_020517	GGC	2	6	5998	6003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417166
98	NC_020517	GAG	2	6	6010	6015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417166
99	NC_020517	CG	3	6	6054	6059	0 %	0 %	50 %	50 %	476417166
100	NC_020517	CGA	2	6	6102	6107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
101	NC_020517	CGTG	2	8	6108	6115	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
102	NC_020517	AGACCA	2	12	6170	6181	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	476417166
103	NC_020517	TGA	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
104	NC_020517	CAT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
105	NC_020517	GCC	2	6	6316	6321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
106	NC_020517	AAG	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417166
107	NC_020517	CGC	2	6	6343	6348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
108	NC_020517	CCG	2	6	6365	6370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
109	NC_020517	TCC	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	476417166
110	NC_020517	CA	3	6	6483	6488	50 %	0 %	0 %	50 %	476417166
111	NC_020517	ATG	2	6	6547	6552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
112	NC_020517	CGGT	2	8	6584	6591	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
113	NC_020517	TCA	3	9	6641	6649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417166
114	NC_020517	GCCGAT	2	12	6652	6663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	476417166
115	NC_020517	TTC	2	6	6703	6708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417166
116	NC_020517	GAT	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417166
117	NC_020517	CCG	2	6	6731	6736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
118	NC_020517	TACGTG	2	12	6739	6750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	476417166
119	NC_020517	GCC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417166
120	NC_020517	AAGGC	2	10	6839	6848	40 %	0 %	40 %	20 %	476417166
121	NC_020517	ACC	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417166
122	NC_020517	CGA	2	6	6993	6998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
123	NC_020517	CGA	2	6	7020	7025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417166
124	NC_020517	GCCGC	2	10	7032	7041	0 %	0 %	40 %	60 %	476417166
125	NC_020517	AAAC	2	8	7274	7281	75 %	0 %	0 %	25 %	476417167
126	NC_020517	GCG	2	6	7373	7378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
127	NC_020517	GCA	2	6	7401	7406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
128	NC_020517	CCTA	2	8	7421	7428	25 %	25 %	0 %	50 %	476417167
129	NC_020517	CCG	2	6	7497	7502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
130	NC_020517	ACG	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
131	NC_020517	ACA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417167
132	NC_020517	TCG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
133	NC_020517	CGA	2	6	7701	7706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
134	NC_020517	GCC	3	9	7711	7719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
135	NC_020517	ACG	2	6	7808	7813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
136	NC_020517	CTG	2	6	7858	7863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
137	NC_020517	CCG	2	6	7874	7879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
138	NC_020517	CCA	2	6	7898	7903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417167
139	NC_020517	CCG	2	6	7909	7914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417167
140	NC_020517	GCT	2	6	7983	7988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
141	NC_020517	CAT	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
142	NC_020517	TCA	2	6	8090	8095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
143	NC_020517	GAG	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	476417167
144	NC_020517	TGG	2	6	8144	8149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
145	NC_020517	GTC	2	6	8188	8193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
146	NC_020517	CGA	2	6	8247	8252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
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148	NC_020517	AAC	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	476417167
149	NC_020517	GCA	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
150	NC_020517	ACC	2	6	8438	8443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417167
151	NC_020517	CGCC	2	8	8457	8464	0 %	0 %	25 %	75 %	476417167
152	NC_020517	ATC	2	6	8770	8775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
153	NC_020517	CGA	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
154	NC_020517	GTG	2	6	8884	8889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
155	NC_020517	TCA	2	6	8912	8917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
156	NC_020517	CGA	2	6	8931	8936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
157	NC_020517	GGC	2	6	8956	8961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
158	NC_020517	GAC	2	6	8992	8997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
159	NC_020517	GTG	2	6	8998	9003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
160	NC_020517	CTT	2	6	9009	9014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417167
161	NC_020517	GCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
162	NC_020517	TTC	2	6	9043	9048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	476417167
163	NC_020517	CTG	2	6	9133	9138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	476417167
164	NC_020517	CGA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
165	NC_020517	TCCA	2	8	9157	9164	25 %	25 %	0 %	50 %	476417167
166	NC_020517	AAG	2	6	9235	9240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417167
167	NC_020517	GGC	2	6	9274	9279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417167
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172	NC_020517	CGA	2	6	9480	9485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417167
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174	NC_020517	GC	3	6	9653	9658	0 %	0 %	50 %	50 %	476417167
175	NC_020517	GTG	2	6	9661	9666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417167
176	NC_020517	CAT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417167
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179	NC_020517	GAA	2	6	9817	9822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417167
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243	NC_020517	ACGAA	2	10	13945	13954	60 %	0 %	20 %	20 %	476417170
244	NC_020517	GCA	2	6	14020	14025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	476417170
245	NC_020517	GC	3	6	14036	14041	0 %	0 %	50 %	50 %	476417170
246	NC_020517	TG	3	6	14046	14051	0 %	50 %	50 %	0 %	476417170
247	NC_020517	ACCGC	2	10	14053	14062	20 %	0 %	20 %	60 %	476417170
248	NC_020517	ACC	2	6	14086	14091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	476417170
249	NC_020517	GTG	2	6	14097	14102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417170
250	NC_020517	GGT	2	6	14130	14135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417170
251	NC_020517	GCC	2	6	14229	14234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	476417170
252	NC_020517	CAT	2	6	14240	14245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	476417170
253	NC_020517	GTAT	2	8	14251	14258	25 %	50 %	25 %	0 %	476417170
254	NC_020517	TGA	2	6	14267	14272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	476417170
255	NC_020517	AAG	2	6	14304	14309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	476417170
256	NC_020517	CGG	2	6	14354	14359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417170
257	NC_020517	GGC	2	6	14403	14408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417170
258	NC_020517	GCG	2	6	14449	14454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417170
259	NC_020517	CGG	2	6	14477	14482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417170
260	NC_020517	GCG	2	6	14518	14523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	476417170
261	NC_020517	CG	3	6	14672	14677	0 %	0 %	50 %	50 %	476417170
262	NC_020517	TGG	2	6	14683	14688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	476417170
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264	NC_020517	CGTG	2	8	14744	14751	0 %	25 %	50 %	25 %	476417170
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